В августе 2002 года при футбольном клубе «СКА–Энергия» была организована Детско-юношеская школа. Она вошла в структуру нашего клуба.
Перед этим событием клубом и его попечителями была проделана большая работа. В частности, на месте гаревого тренировочного поля Стадиона имени Ленина было устроено поле с искусственным газоном, на котором начинали заниматься мальчишки СКА.
В 2012 году на базе ДЮСШ было создано структурное подразделение ФК «СКА–Энергия» - Детско-юношеское отделение или ДЮО.
В 2015 году эта структура клуба была преобразована Центр подготовки юных футболистов, где сейчас тренируются ребята одиннадцати возрастных групп. Общая численность занимающихся – более трёхсот юных футболистов.
Воспитанники Центра подготовки регулярно пополняют ряды молодежного состава ФК «СКА – Хабаровск». В разные годы эта команда выступала в Первенстве ДФО, Хабаровского края, Первенстве для молодежных команд клубов РФПЛ.